高新区种子基金总规模2亿元，成立于2017年6月。基金采用直接投资和基金投资相结合的方式：直接投资部分，以股权投资方式直接或间接投资于注册或拟注册于高新区内的处于种子期的创新型小微企业；基金投资部分，投向高新集团设立的以种子期创新型小微企业为投资对象的子基金。
种子基金重点支持高校教师、科研院所、学生团队创业项目和创新创业大赛优质项目，依托省市优质科教资源，与知名创投机构、孵化器、众创空间等建立紧密联系，力推政产学研深度合作，促进科技成果转化。
截至2022年6月20日，种子基金累计过会项目47个，累计过会投资额超2.26亿元。
